Да, можете. Вы вправе выбрать наиболее выгодный для семьи вариант — по вашим конкретным обстоятельствам. Но вычет в принципе можно получать только с суммы затраченных собственных средств. То есть от цены договора купли-продажи будет отминусована сумма материнского (семейного) капитала. См. п. 5 ст. 220 Налогового кодекса РФ.